Лекции 2017

Компьютерные методы в фармакологии

Курс читает Владимир Борисович Сулимов, доктор физ.-мат. наук, зав. лаб. НИВЦ МГУ имени М.В. Ломоносова.

В настоящее время усиливается роль естественных наук в рациональной разработке лекарственных средств. Цель курса – показать, каким образом современные методы молекулярного моделирования могут быть использованы при разработке новых лекарств. Роль квантовой механики и методов квантовой химии, молекулярной механики и методов молекулярной динамики в конструировании ингибиторов для заданных белков-мишеней, расчетов свободной энергии связывания белок-лиганд, в позиционировании молекул-лигандов в активных центрах белков-мишеней, учете растворителя при взаимодействии белок-лиганд.

В лекциях дается представление о важнейших шагах подготовки белков-мишеней, конструировании молекул-лигандов, их докинге в активные центры белков-мишеней и стратегиях виртуального скрининга больших баз молекулярных структур. Показывается значение естественных наук: физики, механики, квантовой механики, химии, математики, кибернетики, для рациональной разработки лекарств.

В рамках курса слушатели познакомятся с основными современными методами моделирования лекарственных препаратов и самостоятельно проделают ряд практических упражнений, на практике получат представления о методах определения структуры белков, форматы молекулярных данных. Проведут самостоятельную лабораторную работу по подготовке структурных моделей белков-мишеней, лигандов и докинг лигандов в белки-мишени.